江汉大学学报(自然科学版) ›› 2014, Vol. 42 ›› Issue (5): 80-86.

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豇豆SSR标记在豌豆中的可转移性与应用初探

潘 磊1,2 ,徐亚芳 1,2 ,郭瑞1,2 ,李佳楠1 ,胡志辉1,2 ,陈禅友*1,2   

  1. 1.湖北省豆类 (蔬菜) 植物工程技术研究中心, 湖北 武汉 430056;2. 江汉大学 生命科学学院, 湖北 武汉 430056
  • 出版日期:2014-10-25 发布日期:2014-11-11
  • 通讯作者: 陈禅友
  • 作者简介:潘 磊 (1980—) , 男, 讲师, 博士, 研究方向: 植物种质资源与分子育种。
  • 基金资助:
    湖北省自然科学基金项目 (2013CBF213) ; 武汉市科技攻关项目 (2013021001010478) ; 武汉市科技局青年晨光计划项目 (2013071004010476) ; 湖北省豆类 (蔬菜) 植物工程技术研究中心开放基金项目 (2014-10) ;江汉大学高层次人才启动经费项目 (2012027)

Analysis and Application of Transferable SSR Molecular Markers from Cowpea(Vigna unguiculata)to Pea(Pisum sativum)

PAN Lei 1,2 , XU Yafang 1,2, GUO Rui 1,2, LI Jianan 1,2, HU Zhihui 1,2, CHEN Chanyou*1,2   

  1. 1. Hubei Province Engineering Research Center for Legume Plant, Wuhan 430056, Hubei, China;2. School of Life Sciences, Jianghan University, Wuhan 430056, Hubei, China
  • Online:2014-10-25 Published:2014-11-11
  • Contact: CHEN Chanyou
  • About author:陈禅友 (1963—) , 男, 教授, 博士, 研究方向: 植物遗传与育种。E-mail: ccy@ jhun.edu.cn

摘要: 利用豇豆SSR引物筛选在豌豆具通用性的SSR引物。13对豇豆SSR引物中检测出8对引物在豌豆中可扩增, 其中 5对 SSR引物表现出多态性, 进而分析 11个豌豆品种和 5个豇豆品种的遗传多样性与遗传关系。结果表明:平均等位基因数、 平均有效等位基因数、平均 Shannon指数,在豌豆品种群中分别为2. 00、1. 64、0. 55,豇豆品种群中分别为 2. 00、 1. 80、 0. 53,上述遗传参数反映出供试豌豆品种和豇豆品种具有中等水平的遗传多样性; 利用 UPGMA聚类分析,能将豌豆品种群和豇豆品种群分为两类,且每个 品种群内的各个体之间能进行区分, 尤其是两个豌豆品种亚群的聚类结果与其地理来源基本一致。

关键词: 豌豆, 豇豆, SSR, 可转移性

Abstract: Aimed to screen out transferable SSR(simple sequence repeat)molecular markers from cowpea(Vigna unguiculata)to pea(Pisum sativum) . Using thirteen cowpea SSR primer pairs,eight primer pairs were successfully cross-amplified in pea. Five of the eight primer pairs exhibited polymorphism,and then to study the genetic variation of eleven pea cultivars and five cowpea cultivars. Results showed that genetic parameters of the average number of alleles,the average effective number of alleles and the average Shannon′s index are 2. 00,1. 64,0. 55 in the pea cultivar group,and 2. 00,1. 80,0. 53 in the cowpea cultivar group,respectively. These indicated that a moderate level of genetic diversity was revealed in the two cultivar groups. In addtion,UPGMA clustering showed that the pea cultivar group and the cowpea cultivar group clustered into their own branches,respectively. Within each group,most of the samples can be distinguished from each other. Especially,within the pea cultivar group,all the samples can be divided into two subgroups,which are consistent with their geographical origin.

Key words: Pisum sativum, Vigna unguiculata, simple sequence repeat(SSR), transferability

中图分类号: