拟南芥CAS 基因的生物信息学分析及超表达载体构建

江汉大学学报（自然科学版） ›› 2015, Vol. 43 ›› Issue (2): 150-157.

拟南芥CAS 基因的生物信息学分析及超表达载体构建

余璐璐^a，阳敦润^b，曹中权^b，刘龙山^b，罗璐^b，徐飞^*a,b

武汉生物工程学院a.应用生物技术研究中心；b.生命科学与技术学院，湖北武汉430415

出版日期:2015-04-28 发布日期:2015-05-05
通讯作者: 徐飞
作者简介:余璐璐（1984—），女，助教，硕士，研究方向：植物生理生态。
基金资助:
国家自然科学基金项目（31400242）；武汉生物工程学院应用校本研究项目（2014K29）

Bioinformatics Analysis and Over-Expression Vectors Construction of CAS Genes in Arabidopsis

YU Lulu^a，YANG Dunrun^b，CAO Zhongquan^b，LIU Longshan^b，LUO Lu^b，XU Fei^*a,b

a. Center of Applied Biotechnology；b. College of Life Science and Biotechnology，

Online:2015-04-28 Published:2015-05-05

摘要/Abstract

摘要： 对拟南芥氰丙氨酸合酶（cyanoalanine synthase，CAS）基因进行了生物信息学分析，并构建了CAS 合酶基因的超表达载体，以期为其后续功能研究奠定基础。生物信息学分析结果表明，编码拟南芥CAS合酶的CYS -C1和CYS -D1 基因均含有10个外显子和9个内含子，定位于3号染色体，而CYS -D2 基因有9个外显子和8个内含子，定位于5号染色体；3个基因编码的蛋白氨基酸序列相似度较高，CYS-C1蛋白偏碱性且主要在线粒体中起作用，而CYS-D1 和CYS-D2 蛋白偏酸性，主要在细胞质中起作用。通过RT-PCR 扩增了拟南芥CYS -C1 、CYS -D1 和CYS -D2 基因片段，并构建了超表达载体pBI121-35S- CYS -C1 、pBI121-35S- CYS -D1 和pBI121-35S- CYS -D2 ，经检测重组质粒已转化到农杆菌GV3101中。

关键词: 拟南芥, 氰丙氨酸合酶（CAS）, 超表达载体, 生物信息学

Abstract: The CAS genes were analyzed by bioinformatics methods and over-expression vectors of CAS genes were constructed. Bioinformatics analysis show that CYS -C1 and CYS -D1 have ten exons and nine introns，while CYS -D2 has nine exons and eight intron. CYS -C1 and CYS -D1 locate at chromosome 3 while CYS -D2 locates at chromosome 5. Furthermore，the amino acid sequences of CAS genes share a high similarity. However，CYS -C1 is basic protein and functions at mitochondria，whereas CYS -D1 and CYS -D2 are acidic protein and function at cytoplasm. The over- expression vectors of pBI121- 35SCYS-C1 ，pBI121-35S- CYS -D1 and pBI121-35S- CYS -D2 were constructed，and the recombinant plasmids were transformed into agrobacterium GV3101.

Key words: arabidopsis, cyanoalanine synthase（CAS）, over-expression vector, bioinformatics

中图分类号:

Q71
Q782

余璐璐，阳敦润，曹中权，刘龙山，罗璐，徐飞. 拟南芥CAS 基因的生物信息学分析及超表达载体构建[J]. 江汉大学学报（自然科学版）, 2015, 43(2): 150-157.

YU Lulu，YANG Dunrun，CAO Zhongquan，LIU Longshan，LUO Lu，XU Fei. Bioinformatics Analysis and Over-Expression Vectors Construction of CAS Genes in Arabidopsis[J]. Journal of Jianghan University(Natural Science Edition), 2015, 43(2): 150-157.

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