江汉大学学报(自然科学版) ›› 2023, Vol. 51 ›› Issue (1): 28-35.doi: 10.16389/j.cnki.cn42-1737/n.2023.01.004
刘琴,胡曼,朱颖,陈伟达,陈禅友
LIU Qin,HU Man,ZHU Ying,CHEN Weida,CHEN Chanyou
摘要: 为了获得国产大蒜新的凝集素家族基因,根据 NCBI 数据库中已公布的大蒜凝集素基因序列设计引物,从国产大蒜的鳞茎中提取总RNA,采用 RT-PCR 技术分离克隆出一个大蒜凝集素基因,命名为 ASA-C。ASA-C 全长 546 bp,包含 1 个 471 bp的 ORF,编码156个氨基酸的多肽。利用网站和分析软件对其进行生物信息学分析。结果表明:ASA-C 与已公布的同源二聚体大蒜凝集素 ASAⅡ基因具有较高同源性;推测该基因编码多肽的 N 端有一典型跨膜结构域的信号肽,多肽序列上有 3 个甘露糖特异性结合凝集素共有基序(Q-D-N-V-Y)。多重序列比对以及系统进化树的结果表明大蒜凝集素的保守性很强,这为进一步开发利用大蒜凝集素蛋白的功能奠定了基础。
中图分类号: