江汉大学学报(自然科学版) ›› 2020, Vol. 48 ›› Issue (6): 23-32.doi: 10.16389/j.cnki.cn42-1737/n.2020.06.003
袁发浒,刘丽,巴瑞琪,陈江源,黄丽霞,朱书秀*
YUAN Fahu,LIU Li,BA Ruiqi,CHEN Jiangyuan,HUANG Lixia,ZHU Shuxiu*
摘要: 目 的 探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的药理作用机制。方 法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)检索筛选金叶败毒颗粒中金银花、蒲公英、鱼腥草、大青叶的化学成分和作用靶点。查询OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCards 数据库获得疾病相关靶点基因,进而运用Cytoscape 软件构建药物活性分子- 靶点基因作用网络,通过R 语言包clusterProfiler 进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,预测金叶败毒颗粒对COVID-19 的作用机制。结 果 共筛选获得药物活性分子31个。靶点基因110 个,主要包含PTGS2、AR、ESR1、PPARG 、PRSS1、NOS2、NR3C2 等核心靶点。富集分析得到GO 条目2 138 项(P < 0. 05),KEGG 信号通路134 条(P < 0. 05),主要富集的通路有AGE-RAGE 信号通路、动脉粥样硬化、TNF- α 信号通路、甲型流感等。结 论 金叶败毒颗粒的活性化合物能作用于TNF 信号等核心炎症通路,从而对COVID-19 起到抗氧化损伤、抗炎作用。
中图分类号: